Markdown 里面能运行代码么？

原生 Markdown 是不支持的，但是现在有很多插件支持 LaTex 和其他 Diagram ，搜一下，很多的

貌似 Mathematica 更符合需求

Rmarkdown 就可以。

推荐下 ipython notebook

同三楼

同二楼，专业计算你需要 Mathematica Notebook 。

如果只是记录并且喜欢 Markdown 的话可以用 MD 的方言例如：
https://www.madoko.net/
https://atom.io/packages/markdown-preview-plus

身为 Emacs 党必须提一下 org-mode

虽然觉得如果你的笔记数学的内容很多的话 Mathematica 可能更适合一些。

markdown 的要求太多了，偏了 markdown 的初衷。

Markdown 是一种文本标记语言，并不是页面设计语言
Markdown 提供的是一种简单表达文本逻辑关系的标记，而不是具体的排版细节，目的是让你可以在书写时把思路都集中在内容上
所以让 Markdown 去设计细节排版是用错了工具

乍一看标题，感觉要给 md 套上黄金圣衣了

都是文本处理而已，比如你可以自己写一个 Perl 脚本，把特定格式的文字（代码），替换为运行后的处理结果。如果用 Pandoc ，可以用 filter 自己定义一种语法，参考：[Pandoc - Scripting with pandoc]( http://pandoc.org/scripting.html)